昭和14年(1939年)後鳥羽天皇の崩御700年に合わせて建てられました

隠岐造りと呼ばれる建築様式で、銅板葺きの本殿・祝詞舎・拝殿・祭器庫・宝物殿・神門回廊・社務所 などがあります。
神社は桜の名所としても知られ、４月上旬はたくさんの花見客が訪れます。

夜には予約制の「隠岐神社まいり」を開催しており、昼間とは違った隠岐神社を楽しむことができます。(※2名以上の実施となります。)

隣接には、「海士町後鳥羽院資料館」があります。